Shido lernt die bekannte Mangaka Nia kennen und unterstützt sie bei ihrer Arbeit. Dabei erfährt er mehr über ihre wahre Identität.

Nia gibt Shido zu verstehen, dass sie bisher nur für 2D-Charaktere Gefühle entwickeln konnte. Doch sie möchte, dass er sie vom Gegenteil überzeugt und fordert ein Date von ihm.

Shido und Nia haben eine Wette abgeschlossen. Beide treten mit ihrem eigenen Manga auf einer Convention gegeneinander an. Shido wird dabei von seinen Geistermädchen unterstützt. Isaac Westcott schmiedet unterdessen Pläne, wie er Nia ihrer Kräfte berauben kann.

Shido und die Fraxinus-Crew müssen sich einer neuen Herausforderung stellen. Ein Geistermädchen ist im Weltraum aufgetaucht und muss schleunigst versiegelt werden, um es vor der DEM zu bewahren.

Nach Isaacs Angriff findet sich Shido in einer Märchenwelt wieder. Nun muss er schnellstens die restlichen Geistermädchen und ihre Welt wieder finden, um die Offensive der DEM zu verhindern und Mukuro zu versiegeln.

Im Weltraum kommt es zum Endkampf zwischen der DEM, dem AST und dem Geistermädchen Mukuro. Gemeinsam mit der Fraxinus-Crew und den anderen Geistermädchen legt Shido nun alles daran, Mukuro zu versiegeln und ihre verschlossenen Gefühle zu befreien.

Shido soll den Naturgeist Mukuro versiegeln. Im Gegenzug dafür, stellt das Mädchen jedoch eine Forderung, auf die der Schüler nicht eingehen kann. Eine Entscheidung, die weitreichende Konsequenzen hat ...

Die Geister sind auf der Suche nach Tohka und Origami, die wie vom Erdboden verschluckt sind. Doch dann werden die Astralenergien der beiden zusammen mit denen von Mukuro und Shido geortet. Als sich eines der Geistermädchen schließlich einen Kuss von Shido erschleichen will, kommt es zur Auseinandersetzung mit Mukuro.

Für Shido gibt es keine Zeit zum Ausruhen - denn es wartet bereits ein neuer Geist, der es auf die Astralenergie des Jungen abgesehen hat. Und Kurumi Tokisaki ist die Schlimmste von allen. Wird sich Shido im Kampf gegen das Mädchen behaupten können?

Shido und Kurumi kommen sich beim gemeinsamen Mittagessen näher und vereinbaren daraufhin ein Treffen für den Valentinstag. Bevor das Mädchen das Duell an diesem Tag jedoch für sich entscheiden kann, geben die anderen Geister noch einmal alles.

Shido und Kurumi stehen plötzlich dem Geistermädchen Nibelcole gegenüber. Das von Isaac Westcott erschaffene Wesen hat die Mission, Shido zu töten. Unterdessen mischt sich Phantom erstmals in die Geschehnisse ein.