Onizuka Eikichi est un ancien bozuzoku qui agit maintenant comme intérimaire jardinier dans une école secondaire. Il attire immédiatement l'attention en attaquant le principal après qu'il appelle les anciens élèves des déchets. Au milieu de cette situation, Yoshikawa Noburu est victime d'intimidation par Uehara Anko et ses amis. Cet épisode commence le voyage de GTO.

Onizuka vient en aide à une adolescente qui manque régulièrement les cours. Prête à tout pour attirer l’attention de son père, elle n’est pas prise au sérieux lorsqu’elle se trouve réellement en danger…

Les lycéens sont prêts à tout pour se débarrasser d’Onizuka. Ils confient cette responsabilité à Murai, mais celui-ci a d’autres préoccupations plus graves en tête. En effet, son amie d’enfance Haruka semble exercer une activité peu recommandable.

Onizuka vient en aide à Tomoko, une jeune fille très timide et effacée qui échoue dans tout ce qu’elle entreprend. Grâce à son aide et au soutien de ses amis, Tomoko s’inscrit finalement à un concours de chant.

Dojima fait face à de gros problèmes familiaux. En effet, il entretient des relations particulièrement tendues avec le compagnon de sa mère, à tel point qu’il a été placé en foyer. Mais cet homme se lance à sa recherche.

Alors que le camp d’été de la 2-4 est sur le point de commencer, mademoiselle Fuyutsuki commet un impair en voulant aider une élève. Il ne leur en faut pas davantage pour décider de s’en prendre à elle et tenter par tous les moyens de la faire démissionner.

Après la terrible attaque portée contre elle par Miyabi, Kanzaki est très déprimée. Ses idées suicidaires reprennent le dessus et sa mère ne lui offre aucun réconfort.

Alors que les médias ont subitement vent des agissements d’Onizuka et que sa situation au lycée Meishu se précarise, il met tout en œuvre pour venir en aide à Miyabi qui ne s’est toujours pas remise du suicide de son amie Nanako.

Le lycée Meishu tombe aux mains de la redoutable Daimon, appelée à la rescousse pour l’optimiser. mère d’Asano découvre qu’elle entretient une relation avec Kusano qui se destine à une carrière de boxeur.

Alors que Daimon tente de réformer intégralement le lycée Meishu, la résistance de la 2-4 s’organise, avec l’aide d’Onizuka et de Fuyutsuki. Parviendront-ils à venir en aide à Kikuchi ?