Der Battle of Fairy Tails ist vorbei. Laxus wurde von seinem Großvater verbannt. Ein durchgeknallter Reporter eines bekannten Magazins kommt nach Magnolia um einen Artikel über Fairy Tail zu schreiben.

Lucy hat Sorge, dass Natsu in sie verliebt ist. Juvia beschafft sich ein dubioses Zaubermittel, mit dem sie Gray in sie verliebt machen will. Doch das Zeug hat eine ganze andere Wirkung.

Lucys Vater taucht in Magnolia auf. Seine Firma ging pleite und er hat sein gesamtes privates Vermögen verloren. In der Stadt Akalifa hat die dunkle Gilde „Naked Mummy“ eine Handelskette überfallen.

Das Erstarken einer Allianz dunkler Gilden gibt Anlass zur Beunruhigung. Fairy Tail will sich mit drei anderen guten Gilden zusammenschließen, um gegen die dunkle Gilde „Oracion seis“ vorzugehen.

Die Allianz der vier guten Gilden zieht in den Kampf gegen die dunkle Gilde Oracion Seis. Die Bösewichter sind allerdings bestens vorbereitet und sehr viel raffinierter und stärker als erwartet.

Die Bösewichte der Gilde Oracion Seis fügen der Allianz der guten Gilden eine vernichtende Niederlage zu und entführen Happy und die kleine Wendy von der Gilde Cait Shelter.

Natsu und Grey wollen Happy und Wendy aus den Fängen von Oracion Seis befreien. Als sie in der Höhle, wo die beiden gefangen gehalten werden, ankommen, treffen sie dort auf einen alten Bekannten: Jellal.

Mit Happy und Wendy unterm Arm eilt Natsu zu Erza, um ihr mit Wendys Heilkraft zu helfen. Zur gleichen Zeit liefern sich Grey und Leon mit dem Oreicion Seis Mann „Racer“ einen dynamischen Fight.

Kann Wendys Heilkraft Erza retten? Oracion Seis hat NIRWANA endlich gefunden. Was hat die dunkle Gilde mit dieser schrecklichen Magie vor?

Welche Rolle spielt der von Wendy wiederbelebte Jellal? Natsu findet Grey. Aber ist das überhaupt Grey? Und dann taucht noch eine zweite Lucy auf.

Erza ist wieder fit und sucht und trifft Jellal. Doch Jellal hat alle seine Erinnerungen verloren. Wendy macht sich Vorwürfe, dass sie Jellal wiederbelebt hat, denn sie fürchtet, dass er Ungutes anrichten wird.

Brain glaubt am Ziel zu sein – er hat Nirwana wiedererweckt und entfesselt. Nirwana, die ultimative Waffe, mit der Oracion Seis die Weltherrschaft erobern will.

Um Brain zu stoppen, müssen Natsu und Happy zuerst an Cobra vorbei. Da dieser allerdings all ihre Angriffe vorhersehen kann, entfacht ein erbitterter Kampf zwischen ihnen, bei dem Natsu schwer im Nachteil ist.

Als Jura, Lucy und Gray endlich auf Brain treffen, kommt es zum Kampf zwischen dem heiligen Magier und dem Anführer von Oracion Seis. Hot-Eye scheint indes ein leichtes Spiel mit Midnight zu haben. Doch wieso steuert Nirvana ausgerechnet auf Cait Shelter zu?

Erza und Jellal treffen auf Midnight. Da der angeschlagene Jellal kaum fähig ist Magie zu wirken, muss sich Erza recht schnell alleine Midnights Angriffen stellen. Natsu und die anderen treffen auf eine noch seltsamere Gestalt.

Nachdem Erza ihren Gegner durchschaut hat, scheint die Allianz dem Ziel nahe. Doch Zeit zum Durchatmen bleibt ihnen nicht, da Nirvana Cait Shelter immer näher kommt und nun auch noch ein neuer Feind auftaucht, vor dem sich selbst Klodoa fürchtet.

Hibiki ist es gelungen eine Schwachstelle in Nirvana zu entdecken. Die 6 Lacrima, die mit den Beinen verbunden sind, müssen alle gleichzeitig zerstört werden. Bei einer befindet sich allerdings Zero. Wer wird auf ihn treffen?

Während sich die anderen auf dem Weg zu den Lacrima befinden und auf den richtigen Zeitpunkt warten, muss Natsu zuerst Zero besiegen. Unterstützung bekommt er von unerwarteter Seite.

Unwissend, ob sie es schaffen alle gleichzeitig zuzuschlagen, bereiten sich Natsus Kameraden auf den finalen Schlag vor. Kurz vor dem Ende des Countdowns wird Natsu allerdings durch Zeros Magie in die Welt des ewigen Nichts verbannt.

Trotz seines Gedächtnisverlusts soll Jellal vom Rat für seine vorherigen Verbrechen verhaftet werden. Der Gildenmeister von Cait Shelter lüftet sein letztes Geheimnis über Nirvana.

Oracion Seis wurde besiegt, Nirwana wurde vernichtet. Die Mission der Allianz der guten Gilden ist beendet. Wendy und ihre weiße Katze Carla wechseln zu Fairy Tail und werden dort begeistert empfangen.

Immer noch gefangen in Daphnes Hotel, muss sich Natsu Grays Attacken stellen. Der Rest der Gilde macht sich langsam sorgen, wieso Natsu und Wendy noch nicht zurück sind.

Mithilfe von Natsus magischer Kraft kann Daphne nun ihren langersehnten Plan verwirklichen. Erza versucht die Wissenschaftlerin aufzuhalten. Unterstützung bekommt sie von Elfman, Wakaba, und Macao.

Alle Mitglieder von Fairy Tail nehmen ihre Kraft zusammen um Daphnes Drachen aufzuhalten. Natsu steckt immer noch im inneren fest und verliert rasch an Magie.

Wendy und Carla begleiten Natsu, Lucy, Erza, Gray und Happy auf eine Mission zum Berg Hakobe. In Magnolia bereitet sich die Gilde auf das alljährliche Kirschblütenfest vor.

Auf der Suche nach ihrem ersten größeren Auftrag, entscheidet sich Wendy nach Onibus zu gehen. Auf Befehl des Meisters, sollen Fried und Happy sie begleiten.

Fairy Tail veranstaltet das alljährliche 24-Stunden-Ausdauer-Straßenrennen, bei dem alle Mitglieder teilnehmen müssen. Aus Angst vor der Strafe des Meisters für den letzten Platz, geben alle ihr Bestes.

Gildarts kehrt nach langer Zeit zurück zur Gilde. Während die gesamte Gilde in Hochstimmung ist und in alten Erinnerungen schwelgt, hat Gildarts Neuigkeiten für Natsu.

Als es plötzlich unaufhörlich zu Regnen beginnt, offenbart Mystogan Wendy die schreckliche Zukunft von Magnolia.

Natsu, Wendy, Carla und Happy begeben sich nach Edolas um ihre Freunde zurückzuholen. Die Landschaft in Edolas unterscheidet sich stark von ihrer gewohnten Umgebung. Doch das ist nicht das einzig Auffällige.

Carla, Wendy, Natsu und Happy wundern sich. Die anderen FT-Mitglieder verhalten sich alle sehr seltsam. Lucy ist auf Krawall gebürstet und prügelt auf Natsu ein. Sind das überhaupt ihre echten FT-Freunde?

In Edolas gibt es eine eigene FT-Gilde als Parallelwelt. Edolas Hauptproblem ist der akute Mangel an Magie. Der König von Edolas will deshalb die gesamte verbliebene Magie nur für sich haben.

Lucy scheint die einzige aus Earthland zu sein, die in Edolas Magie wirken kann. Gemeinsam mit Natsu, Wendy, Carla und Happy macht sie sich auf den Weg in die königliche Hauptstadt um ihre Freunde zu befreien.

Angekommen in der Hauptstadt, müssen Lucy, Wendy, Natsu, Carla und Happy zusehen wie der König stolz die Lacrima der Bevölkerung präsentiert. Gemeinsam schmieden sie einen Plan um ihre Freunde zurückzuverwandeln.

Während Lucy, Wendy und Natsu gefangen genommen wurden, kehren Carla und Happy ins Königreich der Exceeds zurück und erfahren dort die Wahrheit über ihre Mission. Gajeel hat indes eigene Pläne.

Carla und Happy versuchen aus Extalia zu fliehen und begeben sich auf die Suche nach ihren Freunden. Auf dem Weg begegnen sie einem seltsamen Paar, das ihnen einen Einblick in die Geschichte von Extalia gibt.

Happy und Carla sind immer noch auf der Suche nach Natsu und Wendy. Erza Knightwalker hat es sich zur Aufgabe gemacht, die geflohenen Exceeds persönlich zur Strecke zu bringen. Der König von Edolas offenbart endlich seine wahren Absichten.

Erza und Gray aus Earthland ist es gelungen, sich in den Kampf einzumischen. Während Gray und Lucy Natsu und Wendy zur Hilfe eilen, stellt sich Erza ihrem eigenen Ich aus Edolas. Gajeel begibt sich auf die Suche nach dem verbliebenen Rest der Lacrima.

Lucy und ihre Stellargeister müssen sich gegen Byros Angiffe wehren. Gray verfolgt Sugarboy, der den Schlüssel zurückerobert hat.

Wendy und Carla erreichen Extalia, werden aber alles andere als herzlich empfangen. Während Gajeel langsam Gefallen an dem Kampf mit Panther Lily findet, werden Natsu und Gray gefangen genommen.

Mit aller Kraft kämpfen die verbliebenen Magier von Fairy Tail, um den Aufprall der beiden Inseln zu verhindern. Derweil offenbart die Königin der Exceeds ihre wahre Gestalt.

Gerade als Mystogan erscheint und sich das Blatt zu wenden scheint, greift die königliche Armee erbarmungslos an und König Faust erweckt Dorma Anim, einen mächtigen Drachen, der gegen Magie immun ist.

Lucy aus Edolas versucht die Mitglieder ihrer Gilde zu überzeugen, sich dem Kampf anzuschließen. Diese sind sich allerdings noch nicht ganz einig, auf welche Seite sie sich schlagen sollten. Zeitgleich messen die beiden Erzas erneut ihre Kräfte.

Die drei Dragon Slayer haben große Probleme gegen Dorma Anima anzukommen. Mystogan setzt seinen Plan, Anima umzukehren, in die Tat um.

Als die Magie aus Edolas verschwindet, bricht im ganzen Land großes Chaos aus. Niemand kann sich vorstellen, ohne Magie zu leben. Wer kann die Bevölkerung beruhigen und wieder zur Vernunft bringen?

Endlich gelingt die Rückkehr zurück nach Magnolia. Doch auch die Exceeds werden nach Earthland transportiert, was Carla nicht gutheißt. Da erscheint plötzlich eine weitere Person, mit der niemand gerechnet hat.

Mystogan lässt die königliche Hauptstadt in Edolas wieder aufbauen und auch die Fairy Tail Gilde aus Edolas findet sich mit der neuen Situation zurecht. In Magnolia wird eine große Feier für die Rückkehr von Lisanna abgehalten.