Alicja zdaje trudny egzamin specjalizacyjny z transplantologii. W drodze powrotnej zabiera autostopowicza, Szymona. Zauważa, że chłopak źle się czuje, ale ten bagatelizuje uwagi Alicji i swój gorszy stan zdrowia przypisuje zmęczeniu. Wieczorem karetka zabiera Szymona z akademika. Objawy wskazują na zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych, które jest zaraźliwe i bardzo niebezpieczne. Iza informuje Piotra, że jest w ciąży. Do zespołu lekarzy w Copernicusie dołącza Przemek Karski, który w Toruniu kończy staż na specjalizacji. Jego opiekunem zostaje Alicja. W lokalnej gazecie ukazuje się artykuł oczerniający Elżbietę. Tekst sugeruje, że jest ona złym dyrektorem, a szpital jest zadłużony. Na dodatek jej syn, Janek, wpada w coraz większe uzależnienie od gier komputerowych.

Z powodu braku miejsc w szpitalu Orda nie może wrócić na stałe do Copernicusa. Tymczasowo pracuje jako lekarz pogotowia i jeździ karetką. Podczas jednej z wizyt zostaje pobity. Prosi Elżbietę, by ta rozpatrzyła jego powrót do zespołu. Bosak informuje go, że będzie rozpisany konkurs na chirurga kontraktowego i Daniel będzie pierwszy na liście. Na razie Wanatowie nie chcą informować bliskich o swoim szczęściu. Wkrótce okazuje się, że ciąża Izy jest zagrożona. Alicja i Przemek zajmują się przypadkiem Janusza Kalickiego. Mężczyzna jest cukrzykiem po przeszczepieniu trzustki i nerki. Wykryto u niego tętniaka w miejscu zespoleń. Pacjent ma świadomość, że jego stan jest bardzo poważny i chce uporządkować swoje sprawy, w tym spotkać się z córką i poznać wnuczkę. Alicja przyjmuje kolejne zaproszenie na randkę od Andrzeja. Z kolei Przemek proponuje jej wspólne bieganie i trening do triathlonu.

Do Copernicusa zostaje przywieziona dziewczynka z Afganistanu. Chirurdzy próbują uratować jej nogę przed amputacją. Małą pacjentką zajmuje się Basia oraz Jasiński i Karkoszka, których wspiera Filip w roli tłumacza. Inni członkowie zespołu medycznego sprawdzają obrażenia ofiar wypadku samochodowego, który spowodował 21-letni kierowca. Razem z nim w aucie jechali jego ciężarna dziewczyna i jej brat. Okazuje się, że Przemek opiekuje się nastoletnią siostrą, Hanką, która często popada w kłopoty. Bosak martwi się o Janka, który zamiast przygotowywać się do matury, gra na komputerze. Jivan otrzymuje propozycję wyjazdu w Andy jako lekarz ekipy wspinaczy wysokogórskich. Alicja i Andrzej zaczynają oficjalnie występować jako para. Gustaw i Krystyna przeprowadzają się do Torunia, aby być blisko wnuka. Elżbieta i Krzysztof odkrywają, kto stoi za nagonką na Copernicusa.

Noga dziewczynki z Afganistanu, Mursal, goi się bez powikłań. Michałowi zależy jeszcze, by przeprowadzić operację plastyczną twarzy dziecka. W tym celu zaprasza do szpitala swoją przyjaciółkę, Paulinę Mikulską, która specjalizuje się w chirurgii estetycznej. Basia zauważa, że ordynatora coś łączy z lekarką. Z kolei Paulina widzi, że Torzewska jest zakochana w Michale. Beatę zaczyna niepokoić zaangażowanie Filipa, który wciąż pełni funkcję tłumacza. Piotr wpada na pomysł, aby wynająć surogatkę, która urodzi dziecko zamiast Izy. Przemek znowu musi zaniedbać obowiązki zawodowe, aby zająć się siostrą. Grozi mu zwolnienie ze szpitala. Bosak spotyka się z prezydentem Torunia, który oświadcza jej, że zostanie odwołana ze stanowiska. Alicja trenuje z Przemkiem kolarstwo i nadal spotyka się z Andrzejem. Pod opiekę Kellerowej trafia nastolatka, której nerka po przeszczepieniu odmawia posłuszeństwa. Okazuje się, że dziewczyna nie brała leków, ponieważ nie chciała przytyć.

Piotr i Iza zatrudniają zastępczą matkę. Zostaje nią młoda dziewczyna z Ukrainy, Irmina, której wynajmują mieszkanie w Toruniu. W plany Wanatów wtajemniczony jest tylko Jivan, który polecił im takie rozwiązanie. W Copernicusie pojawia się Władysław Badera z żoną, Urszulą. Aby wymóc na lekarzach natychmiastowe przeprowadzenie operacji kobiety, były policjant porywa Alicję i przetrzymuje ją w pomieszczeniu gospodarczym. Negocjacje z nim prowadzi Andrzej. Ostatecznie Karski zastępuje Kellerową w charakterze zakładnika, by ta mogła przeprowadzić zabieg u żony Badery. Janek nie jest w stanie powstrzymać się od gry na komputerze. Dzień przed maturą wymyka się na spotkanie z kolegami. Jivan decyduje się na udział w wysokogórskiej wyprawie. Karkoszka załatwia Ordzie etat w szpitalu. Daniel ma dołączyć do zespołu docenta, który prowadzi badania nad sztucznym sercem. Sylwia wciąż nie ufa Michałowi.

Do szpitala trafia światowej sławy skrzypaczka, Edyta Bilska, która ma wystąpić w Toruniu na koncercie. Kariera kobiety stoi pod znakiem zapytania, gdyż artystka zaczyna mieć problem z dłońmi. Leczenia jej podejmuje się Jivan. Alicja ma okazję poznać Hannę, siostrę Przemka. Nastolatka bez ogródek stwierdza, że woli, aby jej brat przeprowadził się do Alicji, a nie odwrotnie. Kellerowa i Karski są nieco zażenowani sytuacją. Podczas treningu do triatlonu Przemek doznaje kontuzji stopy. Firma sprzątająca szpital z dnia na dzień przestaje wykonywać swoje obowiązki, co grozi zamknięciem Copernicusa. Bosak musi szybko zatrudnić inną firmę. Ze względu na pospiech Elżbieta nie przeprowadza przetargu, co jest poważnym przewinieniem. Wychodzi na jaw, że Janek nie zdał matury, ponieważ nie pojawił się na egzaminie. Elżbieta zabiera mu laptop. Krzysztof radzi, aby udała się z synem do poradni uzależnień. Iza postanawia, że Irmina zamieszka w domu razem z nią i jej mężem. Piotr nie jest zachwycony takim rozwiązaniem. Filipowi udaje się przekonać ojca Mursal do podpisania zgody na operację plastyczną córki. Musi jednak mu za to zapłacić.

Alicja wyjeżdża z Andrzejem na weekend. Wypoczynek przerywa im zły stan Kuby, który zaczyna gorączkować. Między parą dochodzi do kłótni, kiedy Nowisz stwierdza, że Kellerowa jest nadopiekuńczą matką. Elżbieta zostaje zawieszona w pracy, a obowiązki dyrektora szpitala przejmuje Jerzy. O dalszym losie Bosak ma zadecydować rada miasta. Personel Copernicusa oplakatowuje placówkę i organizuje pikietę w obronie byłej szefowej. Sylwia ma problem z dłońmi. Dziewczyna najprawdopodobniej cierpi na alergię i być może będzie musiała przerwać pracę. Pielęgniarka ma żal do Daniela, że ten broni Karkoszki. Między nimi dochodzi do rozstania. Karkoszka chce zatrudnić kardiochirurga i stworzyć w Copernicusie kolejny oddział. W placówce pojawia się nowa lekarka, Anna Bogna Zaniewska (Olga Bołądź). Kłopoty zawodowe i prywatne Elżbiety zbliżają ją do Krzysztofa. Florczyk oświadcza się ukochanej.

Do zespołu dołącza piękna pani chirurg Anna Zaniewska. Elżbieta traci stanowisko dyrektorki szpitala. Kuba zostaje zatrzymany w szpitalu, najprawdopodobniej cierpi na rozstrzenie oskrzeli. Gustaw i Krystyna oferują, aby Alicja z chłopcem pojechali do Szwajcarii. Bosak zostaje odwołana ze stanowiska, a jej obowiązki przejmuje Tadeusz Karkoszka, który planuje skomercjalizować szpital. Filip organizuje piknik medyczny, aby zebrać fundusze na operację Mursal. Udaje mu się uzyskać wymaganą sumę i dziewczynka przechodzi zabieg. Filip zastanawia się nad założeniem fundacji. Przemek zaczyna staż na neurochirurgii, a jego opiekunem zostaje Anna Zaniewska.

Alicja żegna się z przyjaciółmi i jedzie z Kubą i Andrzejem do Szwajcarii. Sylwia, po wstawiennictwie Daniela, otrzymuje od Karkoszki propozycję awansu. Dziewczyna nie zamierza się jednak sprzedać. Piotr przeprowadza Irminie badanie USG. Żelichowska domyśla się, że Ukrainka ma urodzić Wanatom dziecko. Piotr jest przerażony i pyta byłą kochankę, czego żąda za milczenie. Do Copernicusa trafia 45-letni mężczyzna cierpiący na zaawansowaną postać choroby Parkinsona. Zaniewska przeprowadza udaną operację. Na polecenie docenta Karkoszki zabieg zostaje sfilmowany i umieszczony na stronie internetowej szpitala. Stosunki między Zaniewską a Karskim są napięte. Na SOR zostaje przywieziona młoda dziewczyna z krwiakiem pochwy. W Coperncusie widać podział na nową i starą ekipę.

Janek znajduje swój laptop i znika z domu. Florczyk znajduje go w kawiarence internetowej. Uciekając przed Krzysztofem, nastolatek wpada pod samochód. Po rozmowie z terapeutą Elżbieta postanawia wprowadzić w domu nowe zasady. Profesor Pekold czuje się coraz gorzej. Pozwala Basi samodzielnie operować i chwali ją za dobrze wykonaną pracę. Wkrótce składa wymówienie i odchodzi ze szpitala. Torzewska i Leon odnajdują psa, który pogryzł jednego z pacjentów, Dawida. Na skutek interwencji Pekold udaje się przekonać ojca chłopca, aby pozwolił synowi wziąć zwierzę do domu. Profesor podejrzewa u Dawida chorobę Aspergera. Iza boi się, że stracą dziecko. Żelichowska dodatkowo żąda, aby po zwolnieniu się Piotr zarekomendował ją na stanowisko ordynatora. Wanat spełnia jej warunki. Zaniewska wyznaje Beacie, że nie przepada za Karskim. Jasińska podejrzewa, że Przemek tak naprawdę podoba się Annie. Beata, Karski i Zaniewska z sukcesem usuwają guz mózgu młodej kobiecie.

Docent Karkoszka planuje zlikwidować SOR. Zamierza też pozyskać dla Copernicusa sponsorów. W swoje zamiary wtajemnicza Ordę. Michał odkrywa w gabinecie ojca kopertę z banknotami i listę lekarzy, których Tadeusz zamierza zwolnić. Docent dowiaduje się o piwnicznym azylu chirurgów. Nakazuje Jivanowi i Piotrowi wynieść z pomieszczenia prywatne rzeczy. Wanat spotyka się z matką Irminy. Kobieta żąda, aby zapłacił jej córce 100 tys. złotych. Jivan wybiera się na wyprawę w góry i gromadzi sprzęt. O wyprawie nie poinformował jeszcze Ewy. Lekarzom udaje się wyciąć guza podstawy czaszki mężczyźnie w średnim wieku. Wraz ze zdrowiem wracają również złe nawyki mężczyzny, który przed chorobą był kobieciarzem i często zdradzał żonę. Karski z Wileckim operują ciekawy przypadek przepukliny. Przemek, w odpowiedzi na złośliwości Anny, wiesza w windzie jedną z jej starych fotografii.

Po opublikowaniu zdjęć Anna jest załamana. Jej fotografie w bikini największe wrażenie robią na Wileckim i Gule. Do szpitala trafia mężczyzna, któremu narzeczona podczas kłótni wbiła nóż w serce. Trudną operacje na otwartym organie przeprowadza Orda. Dzięki niemu pacjent zostaje uratowany, co wzbudza podziw wszystkich w Copernicusie. Karski przywozi do kliniki swoją siostrę. Nastolatka miała wypadek na rowerze. Dziewczyna cierpi na obrzęk mózgu i lekarze wprowadzają ją w stan śpiączki farmakologicznej. Przemek dziękuje Zaniewskiej za zajęcie się siostrą i przeprasza za swoje zachowanie. Michał odkrywa oszustwa ojca i dzieli się zdobytymi informacjami z Florczykiem. Leon i Krzysztof udają się do ratusza, aby przedstawić prezydentowi miasta dowody działalności docenta Karkoszki. Okazuje się, że Orda nagrywał dyrektora i prezentuje obciążające go nagrania na sesji rady miejskiej. Podczas treningu Jivan łamie nogę i musi zrezygnować z wyjazdu w Andy. W Irminie budzą się uczucia macierzyńskie, co bardzo niepokoi Izę.