גבריאל הוא סוכן מודיעין אמריקני שבמוחו הושתל שבב שמחבר את מוחו לרשת המידע העולמית. יחד עם סוכנת השירות החשאי שהוקצתה להגן עליו הם יוצאים לחקור את חטיפתו של ד"ר קסידי, הרופא שיצר אותו.

במפקדה חוקרים מתקפת טרור בבסיס נחתים אמריקני ומגלים שקיימת פצצה מיוחדת שאי אפשר לזהות. ריילי נאלצת להגיע להחלטה קשה כאשר גבריאל לא מסוגל להשלים משימה.

גבריאל וריילי נשלחים למצוא את קייט אנדרסון, סוכנת אמריקנית שברחה מהמדינה ובידה מידע מודיעיני רגיש. גבריאל מגלה שמיי בחיים ושהיא יכולה לחדור אל מוחו באמצעות השבב המתקדם שלה.

גבריאל וצוותו נשלחים להציל שני עיתונאים אמריקנים שנשבו בידי הצבא הסורי, שעומד להוציאם להורג. ריילי נאלצת לעבוד לצד חברה לשעבר והאמת בדבר עברם נחשפת.

גבריאל וריילי יוצאים לחיפוש אחר בתו של סנטור אמריקני וחברתה שנחטפו ונלקחו למקסיקו. החוטף, קרטל סמים מקסיקני, דורש את ביטולה של עסקת מכירת לוויין בין ארה"ב למקסיקו.

גבריאל ומפקדת הסייבר צריכים לחקור התפשטות נגיף קטלני בטקסס שנגרמה על ידי אדם שהוצא כביכול להורג על הריגת שני שוטרים. בחקירה מתגלים פרטים מפתיעים על מודיעין משרד ההגנה.

מדענים מכל העולם המתמחים באינטליגנציה מלאכותית מתים באופן מסתורי מדימום פנימי. גבריאל וריילי מתבייתים במהרה על חשוד אך העניינים מסתבכים.

לאחר שמנהיג אופוזיציה שלישי נרצח בבוליביה, גבריאל וריילי נשלחים להגן על מי שמסתמן כמטרתו הבאה של המתנקש, אך זהותו של המתנקש וקשרו עם גבריאל מפתיעים את כולם ומעוררים את זיכרונותיו.

ג'ין קונג בורח מבית הכלא הסיני ופותח במתקפה על המפקדה ובכך גורם לגבריאל לאבד את הזיכרון. תוך ניצול המצב, ג'ין קונג מנסה להשיג רשימה סודית.

לאחר פריצה למאגר הנתונים של התוכנית להגנת עדים, מפקדת הסייבר מתבקשת לפתוח בחקירה. ליליאן נעשית מעורבת אישית בחקירה לאחר שמתברר שהפורץ מתכנן מתקפה בסן פרנסיסקו, שבה בתה גרה.

לאחר שסגן מפקד האף-בי-איי ושני אנשים נוספים נרצחים, מפקדת הסייבר חוקרת את העניין, אך כאשר גבריאל רואה את עצמו בהדמיית הרצח ונלקח למעצר עליו להוכיח את חפותו בעזרת חבריו.

בפרק האחרון, גבריאל מגיע בעזרתן של ריילי ומיי צ'ן לבית אמו, חובשת צבאית לשעבר, על מנת לטפל בפצעיו ולאחר מכן מתפנה לפתרון האירועים האחרונים והקנוניה שהתגלתה לו.