Elizabeth McCord se ve obligada a prestar juramento como presidenta en funciones cuando la Casa Blanca pierde contacto con el Air Force One en el Pacífico. Henry debe reclutar a uno de sus estudiantes rusos para trabajar en el gobierno junto a Jane Fellows, su nueva encargada de la Agencia de Inteligencia de la Defensa.

Tras recibir consejo de la antigua Secretaria de Estado, Madeleine Albright, Elizabeth decide ignorar la recomendación del presidente Dalton sobre negociar el regreso seguro de un empleado del departamento de Estado que fue secuestrado en Afganistán. Henry busca la manera de persuadir a su estudiante, Dimitri, para que espíe al gobierno.

Elizabeth y la administración del presidente Dalton se topan con cierta hostilidad en sus negociaciones con el gobierno ruso. Dimitri es secuestrado e interrogado sobre su espionaje para los rusos. Jill Hennesy regresa como Jane Fellows, la jefa de Henry en la Agencia de Inteligencia de la Defensa.

Tras la muerte del presidente Ostrov, Elizabeth y el presidente Dalton temen un golpe de Estado dentro del gobierno ruso. El coordinador de seguridad informática del gobierno, Oliver Shaw, trabaja para identificar al hacker que interfirió en las comunicaciones con el Air Force One, mientras Jay elabora un plan para combatir la propaganda rusa.

Tras la muerte del presidente Ostrov, Elizabeth y el presidente Dalton temen un golpe de Estado dentro del gobierno ruso. El coordinador de seguridad informática del gobierno, Oliver Shaw, trabaja para identificar al hacker que interfirió en las comunicaciones con el Air Force One, mientras Jay elabora un plan para combatir la propaganda rusa.

Cuando un trabajador humanitario es asesinado en Siria por un conocido líder del estado islámico, Elizabeth recuerda a todos los voluntarios asentados allí, incluyendo su hermano Will, y convierte en su misión hacer justicia a la víctima.

Apoyándose en el Presidente Dalton, Elizabeth intenta conseguir el apoyo del Senado con el objetivo de hacer historia y levantar el embargo del comercio cubano. Henry y Alison hacen buenas migas durante el viaje por La Habana. 

A medida que las tensiones con Rusia aumentan, Elizabeth, Russell y Mike B. elaboran un plan para sacar a Craig Sterling de su papel como consejero de seguridad nacional, sin que ello afecte la imagen del presidente Dalton. Ephraim Ware, el director de Inteligencia Nacional, identifica al responsable de hackear el Air Force One.

Poco antes de que Elizabeth pronuncie su discurso en las Naciones Unidas y acuse a Rusia del ataque al Air Force One, Henry comparte con ella cierta información que le hace reconsiderar su teoría.

Elizabeth y el presidente Dalton descubren un secreto que podría tener impacto en la reputación de Maria Ostrov. Dimitri quiere dejar de ser un espía.

Elizabeth trabaja para mantener la paz, ahora frágil, tras la muerte de Maria Ostrov. Henry está dolito por la pérdida de su estudiante Dimitri. Desde el gobierno se hacen esfuerzos para salvar a los astronautas americanos.

Elizabeth emprende su viaje a Myanmar para discutir asuntos de los países de la costa del Pacífico. Allí, la secretaria de Estado encuentra problemas con el embajador americano.

Después de la muerte del padre de Henry, salen a la luz secretos dolorosos y muy inesperados en la familia. Russell decide ocultar información relevante al equipo de Elizabeth.

Elizabeth debe tratar asuntos de extrema sensibilidad en Arabia Saudí al mismo tiempo que supervisa una misión para encontrar a los responsables de un robo de uranio en Europa del Este.

Después de los inesperados hechos sucedidos en suelo estadounidense, Elizabeth se apresura a encontrar respuesta para todas las preguntas del presidente Dalton sobre cómo ha podido ocurrir.

Después de que un barco italiano responda una llamada de auxilio de otro barco que porta refugiados libios, Elizabeth tiene veinte minutos para decidir si cuestionan a un pasajero que afirma conocer el paradero de Jibral Disah, el terrorista más buscado del mundo.

Elizabeth es acorralada por algunos manifestantes mientras acompaña a Alison en su visita al campus de la universidad. Protestan por una operación de minería que involucra a los gobiernos de EEUU y Chile. Henry intenta seguir la pista de la tercera mujer de Jibral Disah.

Mientras Elizabeth mantiene conversaciones de paz con los primeros ministros de India y Pakistán, un misterioso accidente de avión vinculado a ambos países hace que las tres partes se replanteen el acuerdo. Henry intenta obtener información sobre Disah acercándose a un antiguo profesor de una de las mujeres del terrorista.

Los esfuerzos por negociar la liberación de las estudiantes nigerianas se vuelven inútiles cuando Marburg Virus infecta al emisario enviado a asegurar su regreso.

Henry, Jose y Jane son enviados a Pakistán en una peligrosa misión, cuando el presidente recibe un aviso de que Disah está en Islamabad y podría estar recibiendo ayuda directa del gobierno pakistaní.

EEUU se cuestiona si llevar a cabo un procedimiento de desactivación para asegurar las armas nucleares del gobierno paquistaní antes de que colapse, mientras la estación Murphy persigue al terrorista Jibral Disah.

Cuando Elizabeth recibe impactantes noticias sobre un operativo politico, ella navega en la engañosa situacion politica con el presidente Dalton, quien esta considerando remplazarla como Secretaria de Estado. Stevie y Jareth se comprometen.