הארו ומאקוטו, שעברו לטוקיו, מתחילים את שנתם הראשונה באוניברסיטה. ביומו הראשון בלימודים, הארו פוגש את אסהי, איתו שחו במשחה שליחים בחטיבה. באותו הזמן בסידני שבאוסטרליה, המאמן החדש של רין מציג אותו בפני פנים חדשות.

לאחר ששחו במשחה הראשון שלהם, הארו ואסהי מחפשים את את איקויה אך לשווא. יחד עם מאקוטו וקיסומי, הם פוגשים את חבריו ללימודים ומגלים שהוא עדיין שוחה.

רין שכבר השתקע באוסטרליה, התחיל אימונים אצל המאמן מיקייל. באחד הבקרים מופיע בחור יפני לא מוכר המתחרה מול חבריו של רין ומנצחם בזה אחר זה.

בעקבות מידע המספק להם קיסומי, הארו, מאקוטו ואסהי הולכים לפגוש את איקויה באוניברסיטת שימו בה הוא לומד. התוכנית שלהם נהרסת כאשר הם נתקלים בהיורי המונע מהשלישייה לראותו.

סמזוקה, איווטובי וסופוקן מקימים מחנה אימונים משותף ואליהם מתלווים סוסקה ונטסויה. ריי ונגיסה מבחינים שמשהו אינו כשורה אצל רומיו ונחלצים למצוא פתרון.

מתוסכל ממצבו של איקויה, היורי מנסה למצוא דרך לעזור לו. נאו נפגש עם החבורה ומעלה בהם תובנות חדשות.

בעוד אליפות האוניברסיטאות בפתח, הארו מתחיל לקבל שיעורים פרטיים מריוג'י, המאמן החדש שלו. היורי מתוסכל מהמריבה שפרצה בין איקויה ובינו ונטסויה מגיע לטוקיו מוטרד ממחשבות לגבי מצבו של אחיו.

אבוד, היורי חושף את רגשותיו בפני מאקוטו. הארוקה ואיקויה מתמודדים אחד נגד השני במעורב אישי. מי ינצח ומה תהינה ההשלכות? רמז: בקבוק סודה.

Makoto has been unable to get in touch with Haruka following the friendly race at his training camp, making him worry that Haruka is dwelling on what happened. Then Nao approaches Makoto to tell him about a rumor he heard.

Makoto meets up with the members of the Iwatobi Swim Club who are in Tokyo for the nationals. Meanwhile, Haru continues his training.

Nagisa, Rei, and the rest of the Iwatobi Swim Club have come to cheer on their former teammates at the All-Japan Invitational. Makoto tells them the story of how ever since Haruka swam for the first time, he'd been swimming only freestyle.