Die Highschoolschülerin K.C. Cooper beginnt ihren Job als Geheimagentin im Auftrag der Regierung.

K.C.s fühlt sich schlecht, weil ihre Eltern Ernie nicht für reif genug halten, in das Familiengeheimnis eingeweiht zu werden. Unterdessen wird Marisa zur Klatschkolumnisten der Schülerzeitung.

Marisa überredet K.C. zu einer Cheerleading-Probestunde, sodass die beiden mehr Zeit miteinander verbringen können. Unterdessen versucht Craig, mehr Zeit mit Ernie zu verbringen.

Als Kira und Craig während einer Mission spurlos verschwinden, fordert K.C. Verstärkung an. Zu ihrer Überraschung sind es ihre Großeltern, dir ihr zur Hilfe kommen. Denn diese sind Spione im Ruhestand.

Marisa hat es ins Finale eines Fotowettbewerbs geschafft, und zwar mit einem Foto von K.C.! Unterdessen nutzen Ernie und Craig Judy dafür, die Hausarbeiten zu erledigen.

Nachdem K.C. bei einer Mission versagt hat, verliert sie ihr Selbstvertrauen. Marisa bemerkt, dass etwas nicht stimmt und versucht ihrer Freundin zu helfen.

Die Familie erhält den Auftrag, den attraktiven Prinzen von Tansaberia zu beschützen. Daher soll sich Ernie in der tansaberianischen Botschaft als der Prinz ausgeben.

K.C. wird paranoid, da sie sich von ihrem gesamten Umfeld bedroht fühlt. Unterdessen bringt Ernie eine heiße, neue Freundin nach Hause. Für K.C. steht fest: Sie muss eine Spionin sein!

Die Organisation schickt einen Spion namens Brett, der sich während einer Mission als K.C.s Freund ausgeben soll. Doch K.C. stellt bald fest, dass sie echte Gefühle für ihn entwickelt.

Brett nimmt K.C. gefangen und eröffnet ihr, dass er eine Doppelgängerin in die Cooper Familie einschleusen wird.

Zane benutzt K.C.s Doppelgängerin, um Zugang zu der Organisation zu bekommen. Allerdings hegt Marisa den Verdacht, dass etwas mit ihrer besten Freundin nicht stimmt.

Ein neuer Auftrag verhindert K.C.s Urlaub in Miami. Um ihr dennoch ein wenig Urlaubsgefühl zu vermitteln, versucht Marisa, sie per Videochat auf dem Laufenden zu halten. Unterdessen muss sich Ernie als Spion beweisen!

Ein Nachbar der Coopers wird beraubt. Gegen Craigs Willen versucht K.C., eine Wachgruppe in der Nachbarschaft zu organisieren. Unterdessen bekommt Judy Unterstützung, einen Verehrer abzuwimmeln.

Im Rahmen einer Mission muss sich K.C. als College-Schülerin ausgeben, um die partyverrückte Tochter des Präsidenten zu beschützen. Unterdessen versucht Judy zu beweisen, dass sie Ernie als Abenteuerin in nichts nachsteht.

Die gegnerische Seite rekrutiert Agenten aus einer Jugendstrafanstalt. Um sich bei ihnen unterzumischen, gibt K.C. vor, eine knallharte Strafgefangene zu sein. Wird es ihr so gelingen, das Böse aufzuhalten?

Während ihrer verdeckten Ermittlungen findet K.C. heraus, dass Brett ihr Trainer ist! Wird es ihr gelingen, interne Informationen zu gewinnen und ihn dazu bringen, der Organisation beizutreten? Oder wird man sie entdecken?

Die Coopers machen Familienurlaub und K.C. ist festentschlossen, sich von jeglicher Spionage fernzuhalten. Doch plötzlich verschwindet eine neue Freundin der Familie. Können die Coopers herausfinden, was passiert ist?

Kira bekommt K.C. dazu, mit ihr auf einen feinen Ball zu gehen, indem sie vorgibt, es handle sich um eine Mission. Unterdessen streiten Ernie und Judy darum, wer auf wen aufpasst.

Ein Agentensohn ist plötzlich spurlos verschwunden. Um ihn zu finden, begeben sich K.C. und Ernie auf geheime Mission- auf eine elitäre Jungenakademie. Unterdessen setzt Kira versehentlich Judys Ausschaltknopf außer Betrieb.

Eine gefährliche Vermutung wird bestätigt: Judy wurde von der von der Anderen Seite entführt. Kurzerhand begeben sich K.C. und ein besonderer Gast nach Alaska, um sie zu retten. Doch wird ihnen diese Mission gelingen, oder hat die Andere Seite bereits Besitz von Judy ergriffen?

Während K.C.s und Marisas Halloween-Party, verliert K.C. ihren Spion-Armreif. Derweil verschlägt eine Mission Ernie und Judy nach New York. Dort kommt Ernie versehentlich in Kontakt mit einem gefährlichen Serum, das Wolf-DNS enthält.

K.C. und Ernie können das Kriegsbeil einfach nicht begraben! Doch als eine Mission fehlschlägt und sie zusammen eingesperrt werden, müssen sie an einem Strang ziehen. Werden sie sich befreien können, bevor ihnen die Luft ausgeht?

Kira wird verhaftet, weil man sie für einen Staatsfeind hält. Als sie aussagt, dass ihr die Schuld in die Schuhe geschoben wurde, wird eine Anwältin hinzugezogen, die ihren Namen wieder reinwaschen soll. Doch kann diese wirklich helfen oder schaden ihre Nachforschungen Kira nur?

K.C. hält sich selbst für die weltbeste Schenkerin. Doch Craig ist von ihrem Weihnachtsgeschenk überhaupt nicht begeistert. Kann K.C. das wieder gut machen? Derweil versucht Ernie Judy zu erklären, warum Weihnachten so wunderbar ist.

Brett soll K.C. eliminieren, bringt es allerdings nicht übers Herz. Um ihn vor einem weiteren Spion zu beschützen, bringt K.C. sich selbst und ihre Familie in Gefahr.

K.C. überredet ihre Familie, Brett zur Flucht nach Kanada zu verhelfen. Doch was werden die Folgen dieser Flucht sein?