Quando terroristas sequestram um protesto pacífico, Motoko Kusanagi vê a sua oportunidade de provar o valor do seu novo esquadrão.

Uma doença rara coloca dois cidadãos no centro de uma luta pelo poder militar e económico.

Motoko regressa de uma missão no exterior para descobrir que o seu comandante foi assassinado e só Aramaki parece interessado em fazer alguma coisa.

Quanto mais Motoko investiga a morte do seu comandante, menos sentido faz.

Depois de um herói de guerra ser condenado por crimes de guerra, ele e a sua antiga unidade mantêm toda a cidade refém. A sua exigência: acesso aos segredos de Estado na base de dados Pandora.

O tempo está a esgotar-se para impedir a caixa de Pandora de se abrir.

A vida amorosa de Motoko está a correr melhor do que nunca, e ela até consegue tirar umas férias sem precedentes de 5 horas. Naturalmente, é quando os edifícios começam a explodir.

Os ataques terroristas na cidade de Newport continuam, e o esquadrão de bombardeamentos não está a fazer muitos progressos contra eles. Motoko será que aceita a ajuda de um homem de carne e osso?

Motoko e a sua equipa finalmente aproximam-se do hacker Fire Starter, mas a situação torna-se tensa quando são instruídos a assumir um papel secundário numa operação secreta.