Koro-sensei reminisces about his first meeting with Karasuma, where they first butted heads and fought against each other, ultimately coming to respect one another. However, Karasuma eventually points out their actual meeting wasn't nearly as eventful.

Die Klasse 3-E der Kunigigaoka staunt nicht schlecht. Sie haben einen neuen Lehrer, der ein seltsames, alienartiges Wesen zu sein scheint und droht, die Erde zu zerstören! Doch die Regierung hat mit ihm einen Deal geschlossen…

Die Schüler der 3-E versuchen, das seltsame Wesen, dem sie den Namen „Koro-sensei“ gegeben haben, um die Ecke zu bringen, um die Belohnung einzustreichen. Doch natürlich ist das Ganze nicht so einfach wie gedacht…

Ein sehr schwieriger Schüler kehrt in die Klasse zurück – Karma Akabane, der Schrecken aller Lehrer. Er spielt Koro-sensei Streiche, die tödlich enden würden, wenn Koro-sensei ein normaler Mensch wäre. Ob er den Lehrer in die Enge drängen kann?

Die Regierung schleust die Killerin Irina Jelavić in die Klasse ein, um Koro-sensei doch noch zu erledigen. Ihren weiblichen Reizen scheint das gelbe Tentakelmonster auch sofort erlegen zu sein. Doch die Schüler haben auch noch ein Wörtchen mitzureden…

Die Schüler der 3-E sind die Loser der Schule und eigentlich so etwas wie Verbannte. Doch auf der Schulversammlung stehen sie mit ihren neuen Lehrern und mehr Selbstbewusstsein viel cooler da als früher. Das passt einigen Schülern und auch der Schulleitung gar nicht in den Kram…

Der Schuldirektor tritt auf den Plan und erinnert Koro-sensei daran, dass die Klasse 3-E als eine Abschreckung für die guten Schüler gelten soll. Das lässt Koro-sensei nicht auf sich sitzen und setzt seinen Schülern ein hohes Ziel für die Prüfungen…

Die Klasse macht einen Ausflug nach Kyoto und plant dort natürlich einen Anschlag auf Koro-sensei. Doch dann werden Kaede and Yukiko gekidnappt! Jetzt zeigt sich, was Koro-senseis Schüler alles gelernt haben!

Der Assassine Red Eye wird auf Koro-sensei angesetzt und versucht diesen zu erledigen. Die Schüler sind hingegen ganz auf Klatsch aus, wobei Koro-sensei sie belauscht. Das wird er aber bitter bereuen…

Eine neue Mitschülerin kommt in die Klasse: Eine künstliche Intelligenz, die Koro-sensei den Garaus machen soll. Die Schüler finden das aber nicht besonders hilfreich, weil die Maschine ständig den Unterricht mit ihren Angriffen stört…

Irina trifft auf ihren alten Lehrer Lovro Brovski, der ihr rät, ihren Auftrag aufzugeben. Koro-sensei schlägt ein Match vor, bei dem beide versuchen müssen, Karasuma mit einem Gummi-Messer zu „töten“.

Schon wieder ein neuer Mitschüler! Die Regierung bietet alles auf, und schickt den Jungen Itona Horibe in die Klasse. Dieser hat eine Gemeinsamkeit mit Koro-sensei…

Die Jungs der Klasse 3-E müssen in einem Baseball-Turnier gegen die Top-Spieler der Schule antreten! Koro-sensei setzt natürlich alles daran, dass seine Schützlinge gewinnen, doch das lässt der Schuldirektor nicht auf sich sitzen…

Karasuma wird durch einen neuen Lehrer ersetzt! Akira Takaoka soll die Schüler noch besser auf ihre Aufgabe vorbereiten. Hinter der freundlichen Fassade des neuen Lehrers verbirgt sich aber noch eine andere Seite…

Terasakas Freunde verstehen sich seiner Meinung nach zu gut mit ihrem tentakeligen Lehrer. Also schließt er sich mit Shiro und Itona zusammen, um Koro-sensei hereinzulegen. Doch als alle anderen Schüler auch in Gefahr geraten, ist Schluss mit lustig.

Die Abschlussprüfungen stehen bevor und Koro-sensei stellt eine verlockende Belohnung für jeden in Aussicht, der in seinem stärksten Fach die beste Platzierung der gesamten Schule erringt. Doch da hat die Top 5 der Klasse 3-A etwas dagegen…

Die Schüler treten an, um die Aufgaben der Prüfung zu bezwingen! Endlich zeigt sich, ob Koro-senseis Unterrichtsmethoden Früchte tragen.

Die Klasse 3-E bereitet sich auf die Reise nach Okinawa vor. Dort soll der bisher vielversprechendste Anschlag auf Koro-sensei stattfinden. Irinas alter Lehrer Lovro hat den ein oder anderen Tipp für die Schüler auf Lager.

Koro-sensei wird von den Schülern gezwungen, einen Film über seine peinlichen Angewohnheiten zu schauen, um ihn von der Vorbereitung des besten Anschlags der Klasse 3-E abzulenken. Doch dann kommt alles etwas anders als gedacht…

Einige Schüler wurden vergiftet, um Koro-sensei zu erpressen! Doch das lässt Klasse 3-E nicht auf sich sitzen und versucht, das Gebäude zu infiltrieren, in dem das Antidot aufbewahrt wird.

Karma tritt alleine gegen den gefährlichen Bodyguard Grip an, um seine Niederlage bei den Prüfungen auszugleichen. Um durch die Lounge zu kommen, wird Nagisa als Mädchen verkleidet und direkt von einem reichen Schnösel angeflirtet…

Die Schüler treffen auf ihren nächsten harten Gegner namens Gastro. Koro-sensei unterstützt seine Schüler, indem er codierte Anweisungen zum Besten gibt. Dann stellt sich heraus, wer der Drahtzieher hinter der Erpressung ist…

Der Showdown zwischen dem Drahtzieher hinter der Erpressung und dem furchtlosen Nagisa wird entschieden! Können die vergifteten Schüler gerettet werden?

Die Sommerferien sind fast zu Ende, doch Koro-sensei hat auch zu dieser Zeit eine Prüfung für seine Schüler parat. Um ihren Mut zu testen, schickt er sich jeweils zu Zweit in eine Höhle. Sein Plan: Jede Menge pikanten und interessanten Tratsch sammeln.

Kaede liebt Pudding. Und genau das will sie nutzen! Zusammen mit den anderen Schülern stellt sie einen gigantischen Pudding her, um ihn als Falle für Koro-sensei zu nutzen. Doch dann kommt alles ganz anders und Koro-sensei sieht sich erneut Itona Horibe gegenüber.

Itona versucht alles, um Koro-sensei zu töten. Aber ohne Erfolg. Wütend und von Shiro verlassen, fängt er an zu wüten. Können Koro-sensei und die Schüler ihn beruhigen?

Die Jungs der 3-E bauen ein fernsteuerbares Auto mit einer Fischaugenlinse und Waffen, um damit Koro-sensei anzugreifen. Die Mädchen kommen jedoch schnell dahinter, welchem Zweck diese neue Erfindung auch noch dienen soll. Außerdem erfährt die Klasse den wahren Namen eines ihrer Kameraden.

Isogai arbeitet nebenbei heimlich als Kellner. Dummerweise wird er dabei von den Asano und Co. entdeckt. Sie fordern Isogai und seine Mitschüler zu einem sportlichen Wettkampf heraus. Sollten sie verlieren, droht Isogai der Schulverweis!

Auch die Vorbereitungen auf die Zwischenprüfungen halten die E-Klasse nicht vom Training ab. Doch als sie versehentlich jemanden verletzen, straft Koro-sensei sie mit Lernverbot ab. Werden sie ihre Lektion lernen?

Irina hatte Geburtstag! Und Karasuma soll ihr Blumen schenken. Doch das geht gehörig nach hinten los. Zu allem Überfluss stellt sich der Florist auch noch als „Todesgott“ heraus, der Irina entführt hat. Gelingt es der E-Klasse sie zur retten?

Koro-sensei und Karasuma arbeiten als Team, um die E-Klässler zu retten, die vom Todesgott als Geisel genommen wurden. Mit Irina auf der Seite des Todesgottes haben sie einen fähigen Gegner mehr, der die Rettungsaktion erschwert.

Das Schuljahr schreitet immer weiter voran und langsam müssen sich die E-Klässler Gedanken machen, was sie in Zukunft machen möchten, um nach dem Mittelschulabschluss den richtigen Weg einzuschlagen. Dabei werden sie von den Lehrern ausgiebig beraten.

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Das Schulfest der Kunugigaoka-Mittelschule steht an und bietet die perfekte Gelegenheit, um die Klassenkasse aufzubessern. Die E-Klasse beschließt, ihre besondere Lage auf dem Berg zu nutzen und etwas anzubieten, das so von keiner anderen Klasse angeboten wird.

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Die Trimesterabschlussprüfungen fordern den Schülern bereits beim Lernen alles ab. Der Schuldirektor hat seine ganz eigenen Methoden, den Lehrstoff möglichst effizient zu lehren, doch damit ist sein Sohn nicht unbedingt einverstanden.

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Die Prüfungen dauern an und die E-Klässler geben alles, um sie zu bestehen. Auch wenn alle ihr Bestes geben, entscheidet sich das Duell vor allem zwischen den hellsten Köpfen der Kunugigaoka-Mittelschule. Wer macht das Rennen?

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Koro-sensei muss den Test bestehen, dem Gakuhou ihn unterzogen hat. Mit jeder weiteren Aufgabe begibt er sich in noch größere Gefahr. Wird er es schaffen, um die E-Klasse auch weiterhin unterrichten zu können, oder endet hier das Abenteuer?

Eine große Aufräumaktion ist angesagt, bei der alle E-Klässler mit anpacken müssen. Motiviert machen sich Nagisa und Kaede daran, Koro-sensei beim Aufräumen des Schuppens zu helfen. Doch der Frieden währt nicht lange …

Trotz des plötzlichen Angriffs und Kaedes Wutausbruch hat Koro-sensei ihre innere Stimme gehört, mit der sie um Hilfe flehte. Da er seine Schülerin nicht im Stich lassen will, spannt er die E-Klässler mit ein, um Kaede zu retten.

Nachdem die E-Klässler einen Teil von Koro-senseis Vergangenheit erfahren haben, erzählt er ihnen nun auch den Rest. Die restliche Geschichte umfasst auch das Schicksal von Kaedes älterer Schwester Aguri.

Die Mission der E-Klasse lautete, ihren Lehrer, Koro-sensei, bis zu ihrem Abschluss zu töten. Doch einige der Schüler wollen ihren Lieblingslehrer mittlerweile lieber retten. Ein Teamkampf soll das Schicksal Koro-senseis entscheiden.

Nachdem nur noch Karma und Nagisa übrig sind, will Karma die Schlacht zwischen ihnen in einem direkten Duell entscheiden. Welche Seite wird gewinnen? Wird die E-Klasse Koro-sensei töten, oder versuchen ihn zu retten?

Die E-Klässler haben beschlossen, eine Mission ins Weltall zu starten, um nach einer möglichen Rettung für Koro-sensei zu suchen. Jetzt gilt es, die geeigneten Mitglieder als Astronauten zu entsenden.

Der Valentinstag weckt viele Erwartungen, von denen sich einige erfüllten, andere nicht. Wer wird seine Schokolade bekommen? Und traut sich der ein oder andere, seinem oder ihrem Schwarm die Liebe zu gestehen?

Um den Schülern der E-Klasse eine schöne Erinnerung an ihre Mittelschulzeit zu bescheren, beschließt Koro-sensei, für jeden ein Jahrbuch zu erstellen. Die Schüler sind mit der Auswahl seiner Fotos nicht besonders zufrieden.

Ohne sich um die falsche Berichterstattung der Medien zu kümmern, beschließen die E-Klässler, Koro-sensei auf eigene Faust zu retten. Nun setzen sie ihren Plan um, den Berg zu infiltrieren und zu Koro-sensei vorzudringen, der im alten Schulgebäude auf sie wartet.

Koro-sensei kämpft gegen Yanagisawa und den Todesgott. Er sagt seinen Schülern, dass sie sein größter Schatz wären und wichtiger als sein Leben. Wird er sie beschützen können?

Geschwächt von dem Kampf gegen Yanagisawa und den Todesgott bittet Koro-sensei seine Schüler, ihn zu töten, bevor die Waffe der Regierung ihn erwischt. Nagisa und die anderen müssen eine schwere Entscheidung treffen.

Die Schüler der 3-E machen ihren Abschluss. Nach der Feier erfährt Nagisa, dass Koro-sensei seine Eltern wieder zusammengebracht hat. Sieben Jahre später trifft sich der Großteil der Klasse wieder, um ihr altes Schulgebäude auf Vordermann zu bringen.

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