La vita di Brian Finch prende una piega straordinaria quando usa una droga misteriosa, l'NZT, che gli permette di sfruttare a pieno le capacità del cervello. In occasione di un omicidio legato all'NZT, Brian usa questa droga nel tentativo di stare al passo con le autorità abbastanza a lungo da cancellare il suo nome dalla lista dei sospettati.

Brian rischia di perdere il suo nuovo lavoro di consulente dell’ FBI quando disobbedisce agli ordini di restare fuori dalle indagini sull'omicidio di un famoso giornalista.

Brian aiuta Rebecca e Spellman Boyle ad indagare sull'omicidio di un agente dell'FBI e scopre un legame con un boss latitante di un cartello della droga. Nel frattempo Brian si riconnette con l’ex-fidanzata.

La fedeltà di Brian per l'FBI è messa alla prova quando Sands gli chiede di rubare alcuni documenti segreti dell'FBI sull’NZT; Rebecca va a una mostra di quadri dipinti da suo padre prima di morire.

Brian scopre un segreto sconvolgente sul defunto padre di Rebecca, ma teme che dicendole la verità farà saltare la sua copertura. Brian frequenta un corso di autodifesa e scopre la relazione segreta tra Rebecca e l’agente dell’FBI Casey Rooks.

Quando Brian comincia a sperimentare gli effetti collaterali dell'NZT, il senatore Morra gli chiede di tradire Rebecca in cambio di un'altra inoculazione. Inoltre, Brian cerca segretamente una cura alternativa per se stesso mentre lavora con Rebecca al di fuori dell'FBI per trovare i creatori dell'NZT.

Brian finge di essere malato, per prendersi un giorno libero dal lavoro con l'FBI. Purtroppo, il piano fallisce quando la CIA lo rapisce per usare le sue capacità per una missione che potrebbe mettere in pericolo la vita di Brian.

Quando Naz viene imprigionato con l'accusa di finanziamento del terrorismo, Brian e Rebecca cercano di riabilitare il suo nome, il che li porta alla figlia di Naz, Ava, che rivela un segreto di famiglia che Naz ha nascosto all'FBI.

Grazie ad un accordo con Naz, Brian avrà il suo “quartier generale” se riuscirà a catturare i 10 criminali più ricercati dall’FBI in due settimane. Nel frattempo Brian decide di parlare al padre dell’NZT.

Quando l'ex camerata di Boyle è accusato di omicidio e dà la colpa alla perdita di controllo del braccio protesico, Boyle chiede a Brian di aiutarlo a scoprire se l'arto artificiale sia stato violato. Inoltre, il padre di Brian gli chiede di smettere di lavorare per l'FBI.

Quando l'agente Casey Rooks e il suo team SWAT mettono da parte 80 pillole di NZT per se stessi dopo averle requisite dopo un furto, inizia un'indagine interna che viene vista attraverso le diverse prospettive della cerchia di Brian all'FBI.

Quando un ex membro del suo entourage attenta alla vita del senatore Edward Morra, Brian ha il compito di sabotare le indagini dell'FBI. Mentre l'assassino minaccia di porre fine alla carriera del senatore rivelando la sua connessione con l'NZT, i destini di Brian e Morra si intrecciano e si ritrovano in pericolo.

Brian inizia il suo primo incarico all'FBI quando viaggia a Quantico per offrire le sue competenze per l'unità dell'ufficio che cattura serial killer. Tuttavia, il viaggio prende una piega negativa quando Brian capisce che l'uomo con cui sta lavorando potrebbe aver allontanato un innocente in uno di quei casi cha fanno fare carriera, e che lo ha reso un rinomato profiler.

Quando viene assassinato uno sviluppatore del think tank frequentato da Brian, lui e Rebecca intervistano la versione robotica della vittima che ha creato prima della sua morte per scoprire l'identità del killer. Inoltre, Brian seleziona un agente per aggiungerlo a Mike e Ike come sua terza guardia del corpo.

Brian sviluppa una connessione personale con l'agente dell'FBI Lucy Chiesa mentre la aiuta a chiudere un caso prima che lei sia scoperta. Inoltre, Sands fa una mossa a sorpresa per concludere l'indagine di Rebecca sul senatore Morra.

Quando Sands, il rappresentante del senatore Morra, chiede aiuto a Brian per eliminare una minaccia immediata che deve tenere segreta al politico,Brian scopre il passato pericoloso di Sands. Inoltre, la sorella di Brian, Rachel copre la sua missione con Sands quando l'FBI non riesce a contattarlo per quanto riguarda un nuovo caso.

Brian e Rebecca sono posti sotto quarantena dal CDC dopo essere stati esposti a una sostanza sconosciuta durante un blackout in tutta la città. Poi, nascono problemi di fiducia quando Rebecca cattura Brian usando la sua scorta segreta di NZT.

Quando i rapporti più stretti di Brian implodono a causa della sua incapacità di rompere i legami con Eddie Morra, disobbedisce all'FBI per liberarsi dal controllo del senatore. In Russia cerca Piper, l'ex socia di Morra e ora accesa rivale, e il suo vaccino NZT. Inoltre, Rebecca è vicina a scoprire il collegamento di Brian con l'NZT e il senatore Morra.

La doppia vita di Brian viene scoperta quando il senatore Morra entra in contatto con lui proprio durante la sorveglianza del'FBI dopo il suo viaggio in Russia. Inoltre, Mike e Ike riferiscono a una Rebecca già sospettosa il rapporto di Brian con lo scagnozzo di Morra, Sands.

Quando Rebecca scopre la verità sulla morte di suo padre, prende l'NZT per la prima volta e lo utilizza per ottenere giustizia. Inoltre, Sands fa una mossa pericolosa contro Brian per garantire il successo della sua nuova iniziativa.

Quando l'NZT inonda le strade di New York City rischiando di diventare un'epidemia nazionale, l'FBI e il Dipartimento di Giustizia iniziano una caccia all'uomo in tutta la città per trovare il laboratorio che produce il farmaco. Inoltre, quando mancano le risorse per continuare a cercare Piper, Brian ha problemi di adeguamento alla sua nuova realtà.