為了與犯罪組織古萊姆（クライム）對抗,國際科學特搜隊的鯨井大助決定組織一隊改造人部隊，最後他找到接受手術的四人，分別是：櫻井五郎、東竜、嘉琳·水木（カレン水木）及大地文太。四人背負著改造人失去肉體的痛苦，與古萊姆周旋。

後來因古萊姆引入了侵略機械人，把目標由犯罪轉變成征服地球。因此皇牌突擊隊亦加入了行動隊長Big 1（ビッグワン），令戰況更加白熱化。

L'organisation Crime, dirigée par le malfaisant Iron Claw, entend dominer le monde. Mais le Commander Daisuke Kujirai décide de former une équipe chargée de faire obstacle à la concrétisation de ce projet.

Cyborg warriors were created by the Special Science Investigation Squad to bear nuclear, gravitational, magnetic, and electrical forces. They fight the crime empire known as "Crime".

巨大な組織力と機械怪物で構成され、首領のアイアンクロー（鉄の爪）に率いられる犯罪シンジケートクライムの暗躍に際し、国際科学特捜隊日本支部長官の鯨井大助（ジョーカー）に招集された桜井五郎・東竜・カレン水木・大地文太の4人は、核・電気・磁力・重力のエネルギーを持つサイボーグ戦士ジャッカーとして生まれ変わり、トランプのコードネームを持つジャッカー電撃隊となる。ジャッカーはクライムの陰惨な組織犯罪を捜査して壊滅を目指すが、宇宙的科学力にスケールが拡大していくその攻勢に苦戦を強いられる。そんな中、行動隊長の番場壮吉（ビッグワン）が加わり、5人になったジャッカーは、クライムと雌雄を決するべく戦いを繰り広げていく。

Uma organização mundial chamada ISSIS, que possui filiais pelo mundo todo com sede em Tóquio é responsável pela captura de terroristas e criminosos, e é criadora da Tropa de Choque JAKQ. Essa criação se deve ao fato da terra ter sido invadida por uma organização criminosa. ISSIS significa Esquadrão Científico Especial Internacional de Investigação, que reuniu quatro jovens para formarem um grupo de combate juntamente com a ajuda de ciborgues. Foram então escolhidos quatro jovens para ser o os JAKQ, mas para isso, eles precisavam de poderes especiais, o que os levou a entrar em cápsulas que lhes conferiam super poderes para lutar. Apesar de cilíndricas, essas cápsulas eram chamadas de caixas. No comando estava o Comandante Kujirai Daisuke (Joker), que logo foi sustituído por Banba Sohkichi, sendo ele o quinto e ultimo JAKQ a entrar no grupo.