Ao criar essa adaptação, a intenção era adaptar principalmente "Nascimento", "Assassinos", "Os Cyborgs Mitos" e "Império Subterrâneo de Yomi", e ter os quatro arcos compõem a composição principal da série, adicionando um giro contemporâneo ao enredo. Yomi também marcaria o fim da série, como Ishinomori tinha a primeira intenção.

Para espalhar o tempo entre esses quatro arcos e desenvolver ainda mais os personagens, histórias recém-criadas foram concebidas, juntamente com a compra livre de histórias no Adventure King, Shojo Comic e Weekly Shonen Sunday runs do mangá. O arco "Vietnã" seria re-proposital para um mini-arco em duas partes envolvendo o país fictício de Muamba (juntamente com o fornecimento de uma história revisada para Cyborg 008), enquanto as histórias laterais "Um Cão Fantasma" e "A Estratégia Aurora" também foram escolhidas para serem adaptadas.