애니메이션과 게임을 좋아하는 오타쿠 고등학생인 아키 토모야가 만든 동인게임 제작 동아리인 . 토모야는 같은 학년의 미술부 에이스인 사와무라 스펜서 에리리와 학년 1등인 우등생 선배 카스미가오카 우타하, 존재감 없는 동급생인 카토 메구미, 밴드의 보컬을 맡고 있는 사촌 효도 미치루와 함께 코믹마켓 참가를 목표로 게임 제작에 몰두한다. 10월의 어느 주말, 토모야와 멤버들은 게임 제작을 위한 사전 답사를 떠나고, 메구미가 여주인공을 맡게 될 게임의 내용을 구체적으로 구상하기 시작하는데...

토요가사키 고등학교의 새로운 학기가 시작된다. 2학년이 된 토모야는 봄방학 때 언덕길에서 우연히 만난 소녀의 이미지를 잊지 못하고, 그 소녀를 주인공으로 하는 게임을 만들려고 한다. 그리고 같은 학년이자 학교 최고의 일러스트레이터인 에리리와 인기 라이트 노벨 작가인 3학년의 우타하를 영입하려고 하는데...

토모야는 메구미가 꽤 귀엽다고 생각하지만 특별한 캐릭터를 찾지 못하고, 자신을 평범하게 여기는 메구미에게 게임의 여주인공은 어딘가 특별한 특징이 있고 캐릭터가 있어야 한다고 강조한다. 그리고 게임 동아리의 멤버로 영입하려는 에리리와 우타하를 소개하는데...

토모야는 연휴 동안에 게임의 기획서를 완성하려고 하지만, 시간만 흘러갈 뿐 계획대로 되지 않는다. 에리리와 우타하는 그런 토모야를 찾아와서 나름의 격려와 조언을 해준다. 한편 홋카이도로 가족여행을 떠난 줄 알았던 메구미가 갑자기 토모야의 눈앞에 나타나는데...

토모야는 출판사의 의뢰를 받고 새로운 작품의 발표를 앞둔 우타하를 인터뷰하다가, 그 자리에서 뜻밖에도 게임 동아리에 참가하겠다는 대답을 듣는다. 동아리 멤버들이 한자리에 모여 각자의 역할을 의논하지만, 메구미의 존재감은 여전히 희미하기만 한데...

게임 동아리의 활동이 본격적으로 시작되지만, 여주인공인 메구미의 연기력은 좀처럼 늘지 않는다. 토모야는 에리리에게 메구미와 같이 쇼핑몰에 가기로 한 것에 대해 조언을 구한다. 한편, 우타하는 멋진 플롯을 완성해 오지만 토모야는 좀 더 기다려달라고 하는데…

우타하는 신작의 취재 때문에 편집자인 마치다와 함께 호텔에 머물게 되고, 메구미와 데이트를 하던 중에 중요한 포인트를 깨닫게 된 토모야는 우타하를 찾아 호텔까지 찾아온다. 게임 기획의 플롯에 대해 의논하던 두 사람은 같이 밤을 보내게 되는데…

에리리는 게임의 캐릭터 디자인에 들어가기 전에 여름 코믹마켓에 낼 원고를 완성해야 한다면서 토모야에게 스토리와 상황을 같이 생각해달라고 도움을 요청한다. 한편, 3년 전에 나고야로 이사 갔던 후배 이즈미가 갑자기 동아리 멤버들 앞에 나타나는데…

메구미는 '리틀 러브 랩소디' 게임에 관심을 가지고, 에리리는 겨울 코믹마켓까지는 오직 토모야의 동아리만을 위해 일할 것임을 밝힌다. 한편 여름 코믹마켓의 2일째 날이 시작되고, 토모야와 메구미는 이즈미의 동아리를 찾아가 함께 책을 파는데…

메구미에게 토모야와 이리리가 싸웠다는 걸 전해들은 우타하는 토모야에게 화해할 방법을 알려준다. 토모야와 에리리는 둘이 같이 다녔던 초등학교를 찾아가서 마침내 서로의 속마음을 터놓고 8년 전에 있었던 사건에 대해 이야기하게 되는데…

에리리는 여름 코믹마켓이 끝난 뒤부터 의욕이 넘치고, 이런 모습을 본 우타하는 의아해한다. 한편, 토모야의 사촌이자 여고에서 밴드활동을 하는 미치루는 가출해서 토모야의 집에서 함께 지내게 되고, 이 사실을 알게 된 동아리 멤버들은 놀라는데…

토모야는 동아리 멤버들에게 사촌인 미치루를 소개하며 게임의 음악을 맡기려고 하지만 정작 본인은 관심이 없다고 말한다. 우타하는 오타쿠를 무시하는 듯한 미치루의 모습에 발끈한다. 한편, 미치루는 토모야에게 자기 밴드의 매니저를 맡아달라고 부탁하는데…

드디어 미치루의 밴드인 ‘아이시 테일’의 데뷔 무대가 열리고, 토모야는 밴드 멤버들의 기운을 북돋아준다. 한편, 에리리와 우타하는 토모야가 밴드의 매니저를 맡았다는 사실을 알고 불쾌해 하지만 메구미는 둘을 설득하면서 믿어보자고 말하는데…

메구미를 모델로 수영복 이벤트의 그림을 그리기 위해 호텔을 잡아 수영장을 찾은 토모야, 메구미, 에리리, 우타하, 미치루. 하지만 예상 외의 인물도 찾아오는데.

서로 으르렁대기 바쁜 에리리와 우타하. 두 사람의 사이가 그렇게 된 계기는 1년전, 둘의 첫 만남으로 돌아간다. '사랑하는 메트로놈'이 도서관에 들어온 걸 확인하고 나오던 카스미가오카 우타하에게 말을 건 사람은 사와무라 스펜서 에리리였는데.

시나리오의 마감을 끝낸 우타하는 토모야와 외출에 나선다. 우타하의 지식욕을 채우기 위해 이곳저곳을 돌아다니는 두 사람. 하지만 그 뒤를 밟는 사람이 있었는데.

이즈미와 약속한 장소에 도착했지만 오빠인 이오리까지 같이 나와 당황한 토모야 일행. 게다가 블레싱 소프트웨어의 신작 내용과 겹치는 루즈 앙 루즈의 신작 게임 스태프 중 메인 원화가가 이즈미라는 말을 듣고 충격에 빠지는데.

우타하의 시나리오에 치명적인 문제점이 있다는 것을 발견한 토모야. 우타하가 쓴 만큼 소설과 같이 높은 퀄리티였지만 게임 시나리오로서는 적합하지 않다는 점이었는데.

시나리오 리테이크 및 루트 추가로 에리리의 원화 작업이 예상보다 늦어졌다. 하지만 에리리가 소요한 시간만큼 퀄리티가 늘지 않았다는 우타하의 지적에 에리리는 혼자서 별장으로 향하는데.

드디어 그림을 완성한 에리리는 토모야에게 완성했다는 전화를 하다가 쓰러져버리고 만다. 그러자 토모야는 마스터업 작업을 내팽개치고 에리리가 있는 나스 고원으로 향하는데.

드디어 코미케에 내놓은 'cherry blessing'은 카시와기 에리의 원화와 카스미 우타코의 시나리오인 것을 진즉 발각 당해 30분만에 완판되었다. 게다가 샵에 위탁한 물량도 전부 판매되어 추가 발주에 들어갔는데.

다시 한번 cherry blessing을 플레이해보던 토모야는 메구미가 진지하게 열심히 게임 제작에 임했다는 것을 깨닫는다. 미안함이 커진 토모야는 용기를 내 메구미를 시청각실로 불러내는데.

우타하의 졸업을 축하하러 온 토모야는 지금 멤버로 차기작을 만들고 싶다고 말한다. 그러기 위해 모두의 마음을 움직일 기획서를 작성해 보여줬지만 우타하는 의외의 답을 내놓는데.

코사카 아카네로부터 필즈 크로니클의 신작에 참여할 것을 제의받게 된 에리리와 우타하. 아카네에게 독설을 들어 분해하는 두 사람이었지만 매력적인 기획에 마음이 흔들리는데.

데이트를 하자며 토모야를 다시 한 번 록텐바 몰로 불러낸 메구미. 쇼핑의 마지막 순서로 모자 가게에 들어간 토모야는 카토에게 전에 받은 안경 선물에 대한 답례로 모자를 선물하는데.