토요가사키 고등학교의 새로운 학기가 시작된다. 2학년이 된 토모야는 봄방학 때 언덕길에서 우연히 만난 소녀의 이미지를 잊지 못하고, 그 소녀를 주인공으로 하는 게임을 만들려고 한다. 그리고 같은 학년이자 학교 최고의 일러스트레이터인 에리리와 인기 라이트 노벨 작가인 3학년의 우타하를 영입하려고 하는데...

토모야는 메구미가 꽤 귀엽다고 생각하지만 특별한 캐릭터를 찾지 못하고, 자신을 평범하게 여기는 메구미에게 게임의 여주인공은 어딘가 특별한 특징이 있고 캐릭터가 있어야 한다고 강조한다. 그리고 게임 동아리의 멤버로 영입하려는 에리리와 우타하를 소개하는데...

토모야는 연휴 동안에 게임의 기획서를 완성하려고 하지만, 시간만 흘러갈 뿐 계획대로 되지 않는다. 에리리와 우타하는 그런 토모야를 찾아와서 나름의 격려와 조언을 해준다. 한편 홋카이도로 가족여행을 떠난 줄 알았던 메구미가 갑자기 토모야의 눈앞에 나타나는데...

토모야는 출판사의 의뢰를 받고 새로운 작품의 발표를 앞둔 우타하를 인터뷰하다가, 그 자리에서 뜻밖에도 게임 동아리에 참가하겠다는 대답을 듣는다. 동아리 멤버들이 한자리에 모여 각자의 역할을 의논하지만, 메구미의 존재감은 여전히 희미하기만 한데...

게임 동아리의 활동이 본격적으로 시작되지만, 여주인공인 메구미의 연기력은 좀처럼 늘지 않는다. 토모야는 에리리에게 메구미와 같이 쇼핑몰에 가기로 한 것에 대해 조언을 구한다. 한편, 우타하는 멋진 플롯을 완성해 오지만 토모야는 좀 더 기다려달라고 하는데…

우타하는 신작의 취재 때문에 편집자인 마치다와 함께 호텔에 머물게 되고, 메구미와 데이트를 하던 중에 중요한 포인트를 깨닫게 된 토모야는 우타하를 찾아 호텔까지 찾아온다. 게임 기획의 플롯에 대해 의논하던 두 사람은 같이 밤을 보내게 되는데…

에리리는 게임의 캐릭터 디자인에 들어가기 전에 여름 코믹마켓에 낼 원고를 완성해야 한다면서 토모야에게 스토리와 상황을 같이 생각해달라고 도움을 요청한다. 한편, 3년 전에 나고야로 이사 갔던 후배 이즈미가 갑자기 동아리 멤버들 앞에 나타나는데…

메구미에게 토모야와 이리리가 싸웠다는 걸 전해들은 우타하는 토모야에게 화해할 방법을 알려준다. 토모야와 에리리는 둘이 같이 다녔던 초등학교를 찾아가서 마침내 서로의 속마음을 터놓고 8년 전에 있었던 사건에 대해 이야기하게 되는데…

에리리는 여름 코믹마켓이 끝난 뒤부터 의욕이 넘치고, 이런 모습을 본 우타하는 의아해한다. 한편, 토모야의 사촌이자 여고에서 밴드활동을 하는 미치루는 가출해서 토모야의 집에서 함께 지내게 되고, 이 사실을 알게 된 동아리 멤버들은 놀라는데…

토모야는 동아리 멤버들에게 사촌인 미치루를 소개하며 게임의 음악을 맡기려고 하지만 정작 본인은 관심이 없다고 말한다. 우타하는 오타쿠를 무시하는 듯한 미치루의 모습에 발끈한다. 한편, 미치루는 토모야에게 자기 밴드의 매니저를 맡아달라고 부탁하는데…

드디어 미치루의 밴드인 ‘아이시 테일’의 데뷔 무대가 열리고, 토모야는 밴드 멤버들의 기운을 북돋아준다. 한편, 에리리와 우타하는 토모야가 밴드의 매니저를 맡았다는 사실을 알고 불쾌해 하지만 메구미는 둘을 설득하면서 믿어보자고 말하는데…