En ung kirurg, med autisme tiltræder den kirurgiske enhed på St. Bonaventure hospital. Han skal lære at navigere i det nye miljø og bevise at hans specielle medicinske evner kan redde liv.

Dr. Melendez og dr. Unger opdager at en patient ikke er helt ærlig overfor dem. Dr. Browne må lære at tale med dr. Murphy, mens de haster tilbage til hospitalet med et doneret organ.

Lovgivningen sætter begrænsninger, da en mand og hans hustru skal tage en livsændrende beslutning for deres ufødte barn. Dr. Shaun Murphy kæmper for at tilpasse sig de nye omgivelser derhjemme.

Dr. Shaun Murphy møder en ung patient, der har en skræmmende lighed med hans afdøde bror. Shaun opdager at hans forældre skjulte hans diagnoser for ham.

Shaun og Claire må eksperimentere sig frem for at redde en ung brudgom ben og liv. Jared har det svært med en patient, hvis skader kan være for dybe til at kunne heles.

Dr. Shaun Murphy møder fordomme fra en uventet kant, da han behandler en autistisk patient. Dr. Jared Kalu må se sine egne begrænsninger som kirurg i øjnene.

En grønthandel, som Shaun handler hos, bliver udsat for røveri, og hans begrænsede evne til at kommunikere, udsætter andre for livsfare. Aaron er bekymret for om han gør nok, for at hjælpe Shaun.

Holdet tager sig af en lille dreng fra Congo, der har en alvorlig, medfødt hjertefejl. Murphys seneste møde med sin nabo Lea, gør ham forvirret.

En charmerende ung læge får sat en kollega i en akavet situation. Dr. Glassman foreslår at dr. Shaun Murphy skal mødes med en terapeut.

Dr. Marcus Andrews hverver dr. Neil Melendez til at udføre en meget vanskelig nyretransplantation. Dr. Shaun Murphy beslutter at tage på en spontan tur med sin ven Lea, for at glemme sine problemer.

Komplikationer tvinger holdet til at tage en svær beslutning for tvillingernes fremtidige liv. Efter sin udflugt med Lea, beslutter Shaun at han har brug for mere permanente forandringer.

Dr. Shaun Murphy har mistanke om at hans patient lyver om årsagen til hendes tilskadekomst. Dr. Neil Melendez's privatliv påvirker hans arbejde - og dermed også hans patienters liv.

Dr. Shaun Murphy bliver overrasket over at finde ud af, at en ung kræftpatient identificerer sig selv som pige, til trods for at være biologisk mand.

En operation, der kan rette en teenagers hjertefejl, skaber uenighed mellem Shaun og dr. Morgan. En ny praktikant sætter spørgsmålstegn ved en morders motiv for at melde sig som organdonor.

En lam mand får følelsen tilbage i sine ben, hvilket får Melendez til at tro at han kan komme til at gå igen. Andrew må tage sig af et plastikindgreb der er gået galt, for at redde en kvindes liv.

Dr. Shaun tvivler på nødvendigheden for en operation, som vil give hans patient muligheden for at smile. Dr. Claire Brown og dr. Morgan Reznick opdager at deres patient har løjet om sin identitet.

Shaun bliver distraheret over urovækkende nyheder om Glassman, og begår en fejl der kan ende med at ødelægge hans karriere.