Niles, Jane, Cliff, Rita, Vic en Dorothy zijn nog steeds van miniatuurformaat en Niles zal iets kostbaars moeten opofferen om het team te redden.

Cliff, Jane en Rita vervolgen Dr. Tyme en zijn tijd om mineralen te veranderen, in hun zoektocht om Niles en Dorothy te helpen; Vic ontmoet Roni, een militaire dierenarts die zijn overtuigingen uitdaagt; Tijdens een begrafenis komt Larry oog in oog te staan met zijn verleden.

Niles, Rita en Larry komen terecht in het interdimensionale paleis van Red Jack die Larry gevangen heeft genomen; Cliff bezoekt zijn dochter met Jane; Dorothy's spelletje verstoppertje loopt slecht af.

De Dannyzens houden een feestje in het landhuis om te proberen Danny terug te halen.

Dorothy vindt een nieuwe vriend. Niles is van plan Cliff menselijke upgrades te geven. Larry brengt Rita om zijn familie te ontmoeten nadat ze een slechte auditie heeft gehad.

Dorothy wordt vermist. Terwijl Niles en Cliff op zoek zijn naar haar, krijgt Larry te maken met een aantal tijdloze astronauten die uit de ruimte terugkeren. Er is een begrafenis in de metro. Vic ontdekt een verband tussen Roni en S.T.A.R. Labs.

Miranda helpt de Doom Patrol te beschermen nadat een mysterieus pakket bij het landhuis is aangekomen. Rita's bezoek aan een imker brengt haar ertoe haar verleden onder ogen te zien. Niles reist naar het noorden om Dorothy's moeder te vinden.

Om haar waarde in de underground te bewijzen, brengt Jane Larry naar het landelijke Arkansas om haar te helpen een onschatbaar item op te halen. Niles organiseert een speciale dag voor Dorothy terwijl ze een persoonlijke ontwikkeling voor haar vader verbergt.

Voordat de Doom Patrol een oproep kan beantwoorden om de wereld te redden van The Candlemaker in de seizoensfinale, moeten ze het eerst opnemen tegen lang vergeten denkbeeldige vrienden.