뱀파이어의 상하이 파티장을 급습한 유리와 헌터들. 하지만 커슈너는 사라지고 없다. 악의 세력을 뿌리 뽑으려고 유리 일행은 바다 건너 제국의 심장인 도쿄로 향한다.

부상을 당한 유리는 하나다 박사의 치료를 받고 의식을 회복한다. 하나다의 외동딸인 사키와 가까워진 유리. 한편, 실수를 추궁당한 아가사는 또다시 공격을 준비한다.

무엇이 잠자던 기억을 건드린 것일까. 뱀파이어와의 격렬한 싸움을 끝낸 뒤, 유리는 도그빌에서의 어린 시절을 떠올린다. 그는 어떻게 윌러드를 만나 헌터가 된 것일까.

헌터들은 의문의 죽음을 조사한다. 정보 요원인 이바와 마주친 윌러드. 유리와 도로테아가 시즈오카 고텐바로 떠난 뒤 얼마 되지 않아 도쿄에선 엄청난 사건이 벌어진다.

죽었다고 생각한 형이 유리 앞에 갑자기 나타난다. 그는 지금껏 어디에 있었던 것일까. 도쿄를 빠져나온 백호당 무리는 유리와 도로테아, 료코가 탄 기차를 막아 세운다.

시리우스의 상자가 도쿄에 없음을 알게 된 커슈너. 하지만 뱀파이어 일당에겐 아직 할 일이 남아 있다. 정보원을 만나려고 바에 들른 윌러드는 위급한 상황에 내몰린다.

뱀파이어의 급습, 군대의 반격으로 료코의 집이 불타오른다. 커슈너와 미하일로부터 시리우스의 상자에 얽힌 비밀을 들은 유리. 그는 끓어오르는 분노를 참지 못한다.

시리우스의 상자를 찾으려고 유리는 혼자서 길을 떠난다. 목적지는 시리우스 일족의 성지인 남사할린. 예브그라프의 부름을 받은 미하일도 이미 남사할린에 와 있다.

유리의 아버지, 알렉세이를 알고 있다는 노인. 그러나 유리는 그에게서 어떤 정보도 얻지 못한다. 남사할린 시내로 돌아온 유리는 료코와 이바를 만나자 깜짝 놀란다.

시리우스 왕족의 성스러운 제단에 들어선 윌러드와 헌터. 이들이 발견한 보물은 무엇일까. 예브그라프의 수족인 과학자 클라바인의 군대가 유리와 비숍을 습격한다.

료코와 이바는 유리와 비숍의 뒤를 따른다. 예브그라프와 홀로 대적하려는 유리. 그 앞을 비숍이 가로막는다. 한편, 윌러드와 헌터 일행도 남사할린으로 날아온다.

예브그라프에 맞서는 미하일. 하지만 시리우스의 상자는 이미 예브그라프 차지다. 누가 이 괴물을 제압할 것인가. 유리를 태운 비행선은 최후의 결전을 향해 날아간다.