שבע שנים לאחר שאישה מסתורית בשם מילו הצילה אותו ואת חבריו, דאיסוקה עדיין מתאמן לקראת האסון. ובסופו של דבר, האסון מכה.

על אף שאינה מכירה אותו, מילו מגייסת את דאיסוקה להילחם ברוויז'ן שתוקף את בית הספר. מנהיגיה של שיבויה מנסים להבין את חומרת המצב.

השנה היא 2388 והעולם כולו נגוע במגפה. מילו מספרת לדאיסוקה ולחבריו על העבר, ובהמשך הם מסתבכים.

מוטה מכריז שהרוויז'נים ישלחו מספר אנשים בחזרה לשנת 2017 – בתמורה ל"בובות על חוט". דאיסוקה לא מרוצה מהמצב ונפגש עם רוויז'ן.

לאחר שמוטה נכלא והמשטרה תופסת פיקוד, כוח הגנת שיבויה ממשיך להתאמן. דאיסוקה חושב שהוא המנהיג, אבל קורויווה מעדיף למנות דווקא את גיא לתפקיד.

לאחר שמסיבת יום ההולדת נהרסה, מארימארי מתעמתת עם מילו ודורשת ממנה לחשוף את כל האמת על הרוויז'נים. דודו של דאיסוקה חומק מהמשטרה.

בעוד דאיסוקה כלוא, קורויווה והאחרים מגלים פרטים נוספים על הרוויז'נים ועל המידע שמצוי ברשות התנועה נגד חזרה ושינוי ההיסטוריה. מילו נשבעת שהם יכולים לשוב הביתה.

דאיסוקה והיחידה יוצאים למשימה במטרה להציל את בני הערובה ולהשמיד את המוח הקוונטי המלאכותי – אבל הרוויז'נים מוכנים לקראתם.

בעקבות מעשיו של קאיסאקו, הרוויז'נים ששרדו משנים את תוכניתם. תומכיו של מוטה מחליטים לצאת לפעולה, ואילו כוח הגנת שיבויה פשוט לא מתפקד.

מילו מודיעה לכולם שתוך זמן קצר עליה לחזור לשנת 2010, אבל מבהירה להם שטרם עזיבתה תשתתף בקרב נגד מוקיו בתחנת שיבויה.

הצוות מאזין להודעה ממילו, שחושפת את האמת על התנועה נגד חזרה ושינוי ההיסטוריה. ל"בובות על חוט" נגמרה האנרגיה ולתושבי שיבויה הולכת ואוזלת התקווה.