Season 0 of 創聖のアクエリオン premiered on May 25, 2007.

Genesis of Aquarion (創星のアクエリオン Sōsei no Akuerion) is an OVA series created and directed by Shoji Kawamori and produced by Satelight studio. It is an alternative retelling of the Genesis of Aquarion television series, divided into two parts, Genesis of Aquarion: Wings of Betrayal (創星のアクエリオン 裏切りの翼 Sōsei no Akuerion Uragiri no Tsubasa) and Genesis of Aquarion: Wings of Glory (創星のアクエリオン 太陽の翼 Sōsei no Akuerion Taiyō no Tsubasa). A film compilation with some added and deleted footage and also bonus episode of the original series was released, titled Genesis of Aquarion: Wings of Genesis (劇場版アクエリオン Gekijouban Aquarion Ippatsu Gyakuten Hen).

Season 1 of 創聖のアクエリオン premiered on April 5, 2005.

創聖紀0011年の地球。11年前の大異変により人類は既にその人口の2/3を失っていた。南極の氷が溶解し、1万2千年前に滅びたはずのアトランディアが出現、翼をもつ堕天翅族が蘇った。彼らは高度な科学で作り上げた生物機械兵器神話獣を次々と人類の都市に送り込み人間を捕獲していった。生体エネルギー“プラーナ”を摂取するためである。異変後に、特殊機関“地球再生機構ディーバ（DEAVA）”が設立された。そのエレメント候補生リーナは、アトランディアの勇者“太陽の翼”の復活を予言する。人類は反撃を期して海底遺跡から3機のハイブリッド戦闘機“ベクターマシン”を発掘していた。1万2千年前、堕天翅族を滅亡へ追い込んだとされる伝説の兵器である。ベクターマシンが合体することにより、機械天使アクエリオンが姿を現す。

Season 2 of 創聖のアクエリオン premiered on January 9, 2012.

アポロ、シリウス、頭翅の三人による「創聖合体」によって地球が救われてから、1万2千年後の世界。人類は「アルテア界」と呼ばれる異界から送られてくる巨大兵器「アブダクター」の脅威に晒されていた。アルテアでは「イヴの呪い」と呼ばれる現象によって女性が生まれなくなり、絶滅の危機に瀕した彼らは、種の存続のため地球（ヴェーガ）へと侵攻し女性を攫っていた。アブダクターと戦うために「ネオ・ディーバ」の所有する伝説の機械天使「アクエリア」によって対抗していたが、過去に起こった事故以来、男女エレメントによる合体は禁じられていたため、アクエリアの本来の力を発揮出来ず苦戦を強いられていた。

Season 3 of 創聖のアクエリオン premiered on July 3, 2015.

はるか神話の時代、人が生み出した「文字」と「真理」の間のわずかな乖離から発生した異世界「ロゴスワールド」。それは、現代においてはネット社会の急速な発展により絵文字などの「意味を成さない文字」が増加したことで、その領域を急速に拡大させつつあった。世界的IT企業・ネスタのCEOである剣嵜 荘厳は、軽薄で無意味な文字が蔓延する現代社会を破壊するため、ロゴスワールドの文字をM.J.B.K.（モジバケ）化させて現実世界の文字を侵食し、それに関連付けられた概念そのものを消滅させる計画を企てる。これに対し、荘厳の元秘書である粗朶 桜子はネスタが開発していたロゴスワールド探索用メカ・ベクターマシンを奪取すると、M.J.B.K.による危機を解決するために設立された機関・ディーバの日本支部総司令となり、「声」が生み出す力「創声力」を持つ若者たちを「創声部」に集めて対抗を試みていた。