Wanneer een mysterieuze deal mislukt en meerdere lichamen achterblijven, gaat de Fugitive Task Force naar Virginia om de stukken in elkaar te zetten met de hulp van een bekend gezicht en een nieuwe toevoeging aan het team, speciaal agent Nina Chase. Bovendien blijft Remy worstelen met de nasleep van de verbinding met zijn lang verloren gewaande neefje.

Het team schakelt naar de hoogste versnelling nadat meerdere bomaanslagen lijken gericht te zijn op gepensioneerde NYPD-agenten. Ook besluit Ray dat hij klaar is om de volgende stap te zetten in zijn relatie met Cora.

Wanneer een vrouw op gewelddadige wijze vermoord wordt aangetroffen in een hotelkamer in Brooklyn, komt de taskforce in actie om erachter te komen wie haar daar überhaupt naartoe heeft gelokt; Hana helpt een pas afgestudeerde van Quantico die hoopt in haar voetsporen te treden.

De taskforce leidt de staat om te helpen bij een zoektocht naar vermiste en vermoorde inheemse vrouwen en om de verantwoordelijke seriemoordenaar op te sporen; Barnes heeft moeite om tijd te vinden voor een band met haar vrouw.

Wanneer een debatteam op een middelbare school en hun leraar Engels worden ontvoerd op het platteland van Pennsylvania, snelt de Fugitive Task Force ter plaatse om erachter te komen wie hen heeft meegenomen en wat ze willen, voordat het te laat is. Remy helpt Corey ook uit de problemen.

De Fugitive Task Force komt in actie nadat vier rechercheurs worden doodgeschoten tijdens een gevangenenruil buiten een restaurant in New Jersey. Ondertussen heeft Remy moeite met het hebben van Corey als huisgenoot.

Een drugsdeal tussen twee tieners wordt onderbroken wanneer een vrouw van middelbare leeftijd hen onder schot ontvoert en de Fugitive Task Force op jacht stuurt om hen te redden. Ook stoten Nina en Scola over opvoedingsstijlen.

Wanneer twee gewapende bewakers worden neergeschoten terwijl ze voor miljoenen dollars aan Nigeriaanse kunstvoorwerpen naar een museum in Brooklyn transporteren, haast de Fugitive Task Force zich om de dieven te vangen. Ook spreekt Ray met zijn vader over het naar een hoger niveau tillen van zijn relatie met Cora.

Wanneer een federale rechter en zijn vrouw in New York worden doodgeschoten, gaat de Fugitive Task Force op jacht en ontdekt een connectie met een man die uren verwijderd is van zijn executie in Missouri. Ondertussen worstelen Remy en Hana allebei met het feit dat ze alleenstaand zijn en alleen wonen.

Wanneer twee NYPD-agenten worden neergeschoten door een mysterieuze aanvaller terwijl ze reageren op een overval, moet de Fugitive Task Force snel handelen om de dader te pakken voordat meer agenten het doelwit worden. Ondertussen heeft Barnes het moeilijk als Charlotte wil scheiden en dreigt te verhuizen met de kinderen.

Wanneer een met de maffia verbonden politie-informant vermoord wordt aangetroffen voordat een grote misdaadbaas wordt aangeklaagd op federale aanklachten, gaat de Fugitive Task Force op jacht naar de moordenaars. Ondertussen groeit Hana dichter bij Ethan.

De Fugitive Task Force haast zich om de dader te pakken te krijgen die Manhattan bedreigt met een vuile bom. Ondertussen bereidt Ray zich voor op het vieren van een belangrijke mijlpaal in zijn leven nu zijn huwelijk met Cora nadert.